Convertir formatos de vídeo con Winff

Necesitaba convertir vídeos al formato ipod, y buscando por internet encontré la aplicación Winff, que permite hacer conversiones entre diferentes tipos de fichero de audio. Esta aplicación no es más que una interfaz para la aplicación ffmpeg (por tanto debemos tenerla instalada).
Una vez instalada, no me hacía nada al pulsar sobre convertir, así que saque la consola que incluye para ver que es lo que ejecutaba, y al ponerlo en un terminal me devolvía un error Unknown codec 'xvid'.
Busqué posibles soluciones y una de ellas fue instalar un paquete llamado w32codecs; para ello:
sudo gedit /etc/apt/sources.list
Añadimos al final:
## Medibuntu - Ubuntu 8.04 “hardy”
## Please report any bug on https://bugs.launchpad.net/medibuntu/
deb http://packages.medibuntu.org/ hardy free non-free
después actualizamos repositorios:
sudo apt-get update
instalamos el paquete:
sudo apt-get install w32codecs
Una vez hecho esto, volví a intentarlo y me daba el mismo problema; sin embargo, una vez reinicié el sistema, había nuevas actualizaciones (entre ellas ffmpeg) que instalé y después ya me iba todo correctamente.